Tra le attività dell'Istituto vi è anche la produzione di materiale di propagazione.
Sin dagli anni '60 l'Istituto ha fornito, agli agrumicoltori e ai vivaisti, il materiale di propagazione delle migliori cultivar di agrumi sperimentate, da utilizzare per l'innesto di piante di vivaio e per il reinnesto di piante adulte, nel quadro della riconversione varietale della vecchia agrumicoltura italiana.
L'Istituto sovrintende alla distribuzione del materiale di propagazione agrumicolo di base ed ai controlli della rispondenza varietale e fitosanitaria dei campi di piante madri costruiti nelle diverse regioni agrumicole italiane.